中心的前身是绵阳市卫生防疫站，始建于1963年，位于绵阳市高新区绵兴东路50号。2001年10月15日经批复组建绵阳市疾病预防控制中心，是绵阳市人民政府举办的负责全市疾病预防控制和公共卫生技术管理与服务的正县级社会公益一类卫生事业单位，2014年10月创建成为“三级甲等”疾控中心。具体负责全市流行病学与地方病、职业病、慢性非传染性疾病、免疫规划、病媒生物、健康教育、卫生监测等政府防控疾病策略的实施和技术服务工作。能独立承担食品与健康相关产品、公共场所、学校、职业场所、放射装置与设施等的卫生学检测和技术管理与服务工作。中心占地面积23亩，建筑面积21600平方米。现有超高效液相色谱飞行时间质谱联用仪、超高效液相三重串联四级杆质谱联用仪、三重四级杆气相色谱质谱联用仪、微生物质谱检测仪、基因测序仪等检验检测仪器设备767台（件）。已取得检验检测机构资质认定、职业卫生、放射卫生技术服务机构等资质，率先在全省建立了流感、结核药敏、艾滋病等专业实验室；建有3个市级重点实验室，1个市级重点专科；近5年年均发表论文48篇，获得科研立项9项，获得省科技进步二等奖1项、三等奖1项，市科技进步二等奖1项；是四川大学、西南医科大学等6所高等院校教学实习基地，也是绵阳市预防医学会会长单位。