中国科学院空间应用工程与技术中心前身是1993年成立的中国科学院空间科学与应用总体部。随着我国空间站工程全面展开，2010年11月，中科院党组决定在总体部基础上筹建空间应用中心，2012年8月，获中编办批准正式成立。空间应用中心是中国载人航天工程运行与管理支持中心的依托单位，承担我国载人航天工程技术抓总、预先研究管理、应用成果管理和推广、数据管理、国际合作、科普公益以及空间站运营管理规划、应用任务规划及项目论证评估等工作，为载人航天工程发展提供科学、技术和管理全面支撑。同时中心作为载人航天工程空间应用系统总体单位，负责载人航天工程应用系统研制的组织管理，系统设计、集成、测试，可靠性保障，有效载荷在轨运控管理和数据服务等系统技术支持、支撑等工作。