新疆医学会是新疆各族医学科学技术工作者自愿组成并依法登记成立的学术性、公益性、非营利性法人社团，是自治区党委和政府联系医学科技工作者的桥梁和纽带，是发展自治区医学科学技术事业的重要社会力量。新疆医学会成立于1951年，目前有65个专业委员会，104个专业学组，50个青年委员会。业务主管单位为自治区卫生健康委员会，现挂靠在自治区医疗卫生服务管理指导中心。新疆医学会主要工作包括开展国际间、区内外医学学术交流；继续医学教育；医学科技项目的评价、评审和医学科学技术决策论证；评选和奖励优秀医学科技成果（包括学术论文和科普作品等）；编辑出版《新疆医学》杂志；医疗事故技术鉴定和预防接种异常反应技术鉴定；健康知识科学普及；承接政府委托职能及任务；向党和政府反映医学科技工作者的意见和要求。经过历届理事会的不懈努力，新疆医学会已发展成为拥有个人会员2万人、团体会员单位149家的医学科技工作者之家，为中华医学会优秀地方医学会，自治区民政厅5A级社团组织，连续多年获得自治区科协先进学会称号。