深圳药检院原为深圳市药品检验所，成立于1982年7月。2003年增设“深圳市医疗器械检测中心”。2015年更名为“深圳市药品检验研究院”。2017年获批“中华人民共和国深圳口岸药品检验所”。2018年成为全球第46家、中国第2家、地方第1家世界卫生组织药品质量控制认证（WHO-PQ认证）实验室。2020年成为国内首家联合国药品检测全球长期合作实验室。深圳药检院是法定的集药品、医疗器械、化妆品检验和科研于一体的专业检测机构，业务领域涵盖国家、省、市监督、评价、应急检验，进口检验，国际组织委托的检验与科研，产品质量标准制修订与检验研究，培训教育及技术检查，生物医药产业发展技术平台建设等。实验室建筑面积6.2万平方米，各类大型精密检验仪器5000余台/套，固定资产14.4亿元。拥有WHO-PQ认证专家、欧洲药典委员会委员、国务院政府特殊津贴、国家药典委员会委员、国家级省级评审检查员、博士生及硕士生导师等各类专家群体。通过实施“质量化、标准化、品牌化、国际化”发展战略，搭建起国际、国内平台基地30余个，建立LIMS系统为核心的实验室信息化管理系统，实现从样品受理、分发、数据记录、审核、签发涉及人、机、料、法、环、测等全过程的信息化动态管理。全国率先开发中药检验自动化、信息化、智能化前处理系统，填补了国内中药检验与智能化相结合的空白。实验室先后通过CMA、CNAS、WHO等国内外权威部门和国际组织的认证认可检查，检验检测软硬件条件、综合实力位居全国药检系统第一方阵，检验技术能力、科研工作、实验室体系管理、信息化建设等四大领域工作走在行业前列。遵循“检验依托科研，科研提升检验”的方针，通过多年的发展，取得多项开创性科研成果。是地方药检机构首家国家博士后科研工作站设站单位，立足培养药检领域高层次人才；获批“中药质量研究与评价重点实验室”、“化妆品监测评价重点实验室”、“仿制药评价生物等效性重点实验室”3个国家药品监督管理局重点实验室，建成9个省级重点实验室。完成13项《国际药典》、全球基金药品质量标准研究，制修订产品质量标准700余项；获授权国家发明专利、美国专利、PCT专利20项；获省级一、二、三等科技进步奖及专利奖7项；其他奖励100余项。与联合国、世界卫生组织以及美国、德国、日本、香港、澳门等国际组织、知名院校开展了多领域、深层次的合作交流。