中心成立于2004年9月，是隶属市卫生健康委的正处级全额事业单位，承担全市疾病预防控制、公共卫生监测、健康教育及预防医学科研、教学培训等工作，是全市疾病预防控制和卫生检测检验工作的指导中心。中心是济宁医学院、山东医科大学、山东医学高等专科学校的社会实践教学基地。中心办公区位于北城新区北京路3号，东临沂河，西邻市政府行政办公中心，中心办公区建筑面积12800平方米，其中，实验室5000平方米，拥有万元以上大型检验监测设备392台（其中10万元以上158台、50万元以上48台），建有各类专业实验室25个。中心按照“内强素质，外树形象，团结进取，争创一流”的总体要求，建立了一支政治思想过硬、业务素质良好的专业技术队伍。中心现有在职职工155人，本科以上学历146人，其中硕士研究生50人，博士研究生7人，副主任医师以上职称44人，设有7个管理科室和16个业务科室，建立有较完善的质量控制体系，设有质量控制科、病毒检验科、细菌检验科、理化检验科，检验专业技术人员27人，现已通过实验室认可和计量认证，已开展卫生检测检验项目148类、1332项。